MTs Al Jihad didirikan atas pemikiran memanfaatkan kosongnya kegiatan Gedung TPA/MDA di pagi hari  tersedianya potensi SDM guru dan pendirian Yayasan sebagai badan hukum yang menjadi syarat utama sebuah lembaga pendidikan swasta formal.

Maka pada tahun 2000, MTs (Madrasah Tsanawiyah) Al Jihad resmi didirikan.

MTs Al Jihad sejak didirikan hingga tahun 2018 dikepalai oleh Drs. H. Burhanudin, MM. MTs Al Jihad memperoleh ijin operasi pada 2001.

Hingga 2023, MTs Al Jihad telah mewisuda 24 angkatan. Kini, di usianya yang memasuki 27 tahun dan sepeninggal H. Burhanudin, MTs Al Jihad dipimpin oleh ust. Akhirun, SPd dengan jumlah murid 82 orang